国家级重点学科（1个）：药剂学
国家中医药管理局中医药重点学科（1个）：中药分析学
辽宁省重点学科（2个）：药学（一级学科）、中药学（一级学科）
辽宁省特色学科建设工程“提升学科”（2个）：药物化学、药物分析学
辽宁省特色学科建设工程“特色学科”（1个）：中药学（一级学科）
沈阳药科大学校级重点学科（3个）：生物化工、应用化学、企业管理
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